真言宗・天台宗はお線香を3本(身・口・意、または仏・法・僧に)、禅宗(曹洞宗・臨済宗など)はお線香を1本または2本(戒律・禅定を誓って)、浄土真宗(大谷派・西本願寺派)はお線香1本を、それぞれ折って横にします。
ただし、決まりのない宗派もあります。
もし「正しいやり方で」という人は、 菩提寺のお坊さんに尋ねるとよいでしょう。
お墓参りでは普通、一束のままか半分に分けていますが、それで構いません。供養する心が大切なのですから、あまり形式にこだわる必要はありません。なお、お線香は完全に燃やしておくのがマナーです。